臺灣牙周病醫學會為非營利社團，以發展牙周病學暨植體學之研究、教學及醫療，促進國民牙周之健康，並以樹立及維護此一專科之標準及權益為宗旨。

本學會創立於1987年，原名「中華民國牙周病醫學會」，由張文魁醫師召集籌備，並被推舉為首任理事長。其後每兩年改選理、監事會，以會員大會為最高權利機構，在會員大會閉幕期間由理事會代行其職權。因應國際局勢，本會於2007年更改英文名稱為Taiwan Academy of Periodontology，後續變更中文名稱沿用至今。

本會現有會員超過900名，其中約有480名為衛生福利部頒定之牙周病專科醫師。為確立牙周專業的培訓與審查，本會於第三屆開始設置專科醫師甄審委員會，規劃牙周病專科醫師制度，自1994年起每年定期舉辦筆試與口試甄審，又於2022年起承辦衛生福利部委託牙周病科專科醫師甄審與訓練機構審查之初審作業，並將依此培訓更多優良的牙周病專科醫師。

為提供給國內外相關領域之醫師更多學術發表與交流的平台，本會於1996年創刊中華民國牙周病醫學會雜誌，是本會中文官方學術期刊。後於2008年改名為臺灣牙周病醫學會雜誌，經同行評審刊登中英文論文，並持續出版至今。為分流英文論文，2018年創辦英文版學術期刊Journal of Periodontics and Implant Dentistry，已於2022年獲醫療品質策進會推薦為優良期刊。

本會恪守推廣牙周病學暨植體學研究、教學及臨床訓練之任務，定期或不定期舉辦各項學術研討會、論文發表、競賽與病例討論會，並積極參與國內、外各社團之學術交流，不遺餘力。